在 USD（Universal Scene Description）的协作工作流中，理解分层架构与引用机制是构建大型场景的关键。根据提供的资料，USD 通过 SubLayers（子层）和 References（引用）提供多种组合资产的方式，支持大规模影视制作中的协同创作。
针对核心问题：当底层节点移动后，上层覆盖（Overs）中的变换属性是否会失效？答案是否定的。在 USD 的架构设计中，Overs（覆盖层）中的变换属性是独立于底层几何体或变换定义的。即使底层 Prim（主元）的位置发生了变更，只要 Overs 中明确定义了新的变换属性，这些属性将直接生效并覆盖底层数据。USD 的解析器会按照从底层到顶层的顺序应用所有属性，后定义的值优先于先定义的值。
关于如何确保动画数据与几何体在重新组合后保持正确的空间关系，关键在于理解“层偏移”（Layer Offsets）和“时间采样动画”的概念。Overs 不仅可以覆盖静态属性，还可以包含随时间变化的动画数据。当场景图重组时，USD 会遍历所有层级，将底层的基础变换与上层定义的变换叠加。如果底层节点移动，而 Overs 中包含了针对该节点的特定动画或偏移量，系统会自动计算最终的世界坐标位置。
此外，资料中提到 USD 支持多种层格式转换和属性检查工具（如 usdresolve、usdtree），这些工具有助于在复杂场景图中追踪属性的来源。对于大型协作场景，建议利用 USD 的引用机制将资产模块化，并在合并时使用 SubLayers 来管理不同版本的覆盖数据。这样可以确保无论底层几何体如何调整，上层的动画逻辑和视觉覆盖都能保持独立且正确，从而维持场景的空间一致性。
总之，USD 的分层设计保证了变换属性的独立性，使得在动态调整场景结构时，无需担心上层动画数据的丢失或错位，只需确保各层级属性定义的顺序符合预期即可。